{"id":47646,"date":"2026-07-24T08:49:02","date_gmt":"2026-07-24T06:49:02","guid":{"rendered":"https:\/\/kymos.com\/news\/bioanalisi-degli-acidi-nucleici-espansione-delle-capacita-analitiche-con-lc-ms-ms\/"},"modified":"2026-07-24T08:56:04","modified_gmt":"2026-07-24T06:56:04","slug":"bioanalisi-degli-acidi-nucleici-espansione-delle-capacita-analitiche-con-lc-ms-ms","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/kymos.com\/it\/news\/bioanalisi-degli-acidi-nucleici-espansione-delle-capacita-analitiche-con-lc-ms-ms\/","title":{"rendered":"Bioanalisi degli acidi nucleici: espansione delle capacit\u00e0 analitiche con LC-MS\/MS"},"content":{"rendered":"<div class=\"fusion-fullwidth fullwidth-box fusion-builder-row-1 fusion-flex-container has-pattern-background has-mask-background nonhundred-percent-fullwidth non-hundred-percent-height-scrolling\" style=\"--awb-border-radius-top-left:0px;--awb-border-radius-top-right:0px;--awb-border-radius-bottom-right:0px;--awb-border-radius-bottom-left:0px;--awb-padding-top:0px;--awb-flex-wrap:wrap;\" ><div class=\"fusion-builder-row fusion-row fusion-flex-align-items-flex-start fusion-flex-content-wrap\" style=\"max-width:calc( 1170px + 20px );margin-left: calc(-20px \/ 2 );margin-right: calc(-20px \/ 2 );\"><div class=\"fusion-layout-column fusion_builder_column fusion-builder-column-0 fusion_builder_column_1_1 1_1 fusion-flex-column\" style=\"--awb-bg-size:cover;--awb-width-large:100%;--awb-margin-top-large:0px;--awb-spacing-right-large:10px;--awb-margin-bottom-large:20px;--awb-spacing-left-large:10px;--awb-width-medium:100%;--awb-order-medium:0;--awb-spacing-right-medium:10px;--awb-spacing-left-medium:10px;--awb-width-small:100%;--awb-order-small:0;--awb-spacing-right-small:10px;--awb-spacing-left-small:10px;\"><div class=\"fusion-column-wrapper fusion-column-has-shadow fusion-flex-justify-content-flex-start fusion-content-layout-column\"><div class=\"fusion-text fusion-text-1\"><p><span style=\"background-color: rgba(0, 0, 0, 0); font-size: 14pt;\">I farmaci a base di acidi nucleici sono emersi come una delle classi di medicinali innovativi in pi\u00f9 rapida crescita, offrendo nuove opportunit\u00e0 terapeutiche per malattie tradizionalmente difficili da trattare con piccole molecole convenzionali o prodotti biologici. Gli oligonucleotidi antisenso (ASO), i piccoli RNA interferenti (siRNA), gli aptameri, i farmaci a RNA messaggero (mRNA) e altre modalit\u00e0 basate su acidi nucleici stanno progredendo rapidamente nello sviluppo farmaceutico, determinando la necessit\u00e0 di metodi bioanalitici robusti in grado di caratterizzare accuratamente queste molecole complesse (1,2). <\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Rispetto alle piccole molecole tradizionali, i farmaci oligonucleotidici presentano sfide analitiche uniche. Le loro dimensioni molecolari relativamente grandi, l&#8217;elevata polarit\u00e0 e la suscettibilit\u00e0 alla degradazione mediata da nucleasi complicano l&#8217;estrazione e la quantificazione da matrici biologiche. Inoltre, spesso generano metaboliti troncati che possono differire dal composto parentale di un solo nucleotide pur presentando propriet\u00e0 farmacologiche o tossicologiche distinte. Di conseguenza, metodi bioanalitici sensibili e selettivi sono essenziali per supportare studi farmacocinetici, tossicocinetici, di biodistribuzione e di biomarcatori (1\u20133).   <\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">In Kymos supportiamo la bioanalisi di farmaci a base di acidi nucleici utilizzando metodologie basate su biologia molecolare e spettrometria di massa, sviluppando metodi analitici adatti allo scopo sia per studi preclinici che clinici.<\/span><\/p>\n<h2><strong>Approcci bioanalitici per farmaci a base di acidi nucleici<\/strong><\/h2>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">La strategia analitica dipende sia dalla modalit\u00e0 terapeutica che dagli obiettivi di ciascuno studio. Poich\u00e9 nessuna singola tecnologia pu\u00f2 rispondere a tutte le domande analitiche, spesso si combinano tecniche analitiche complementari per affrontare diversi endpoint bioanalitici. In Kymos, questi approcci includono:  <\/span><\/p>\n<ul>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Quantificazione di biomarcatori utilizzando PCR quantitativa in tempo reale (qPCR) altamente sensibile, con rilevamento fino a 1 pg\/mL.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Quantificazione di oligonucleotidi terapeutici utilizzando ELISA a ibridazione, qPCR e LC-MS\/MS.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Quantificazione di DNA, mRNA, siRNA, aptameri e antagomiR.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Analisi dell&#8217;espressione genica utilizzando il metodo \u0394\u0394Ct.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Rilevamento di DNA o RNA virale e batterico.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Studi di biodistribuzione per farmaci e vaccini a base di DNA e RNA.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Analisi del DNA umano residuo per valutare l&#8217;efficienza della decellularizzazione dell&#8217;allotrapianto.<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Sebbene la qPCR rimanga il metodo di scelta per molte applicazioni di biomarcatori ed espressione genica, la crescente complessit\u00e0 degli oligonucleotidi terapeutici ha favorito l&#8217;adozione di tecnologie analitiche complementari che forniscono maggiore specificit\u00e0 molecolare e caratterizzazione dei metaboliti.<\/span><\/p>\n<h2><strong>LC-MS\/MS: espansione del toolkit analitico<\/strong><\/h2>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">I recenti progressi nella cromatografia liquida accoppiata alla spettrometria di massa tandem (LC-MS\/MS) hanno notevolmente ampliato il toolkit analitico disponibile per gli oligonucleotidi terapeutici (2\u20134). A differenza dei saggi ELISA a ibridazione, LC-MS\/MS identifica direttamente gli analiti in base alla loro massa molecolare e ai pattern di frammentazione caratteristici, consentendo la quantificazione accurata del composto parentale insieme alla discriminazione di metaboliti strettamente correlati. A differenza dei metodi basati su ibridazione, LC-MS\/MS fornisce rilevamento molecolare diretto, consentendo non solo una quantificazione accurata ma anche la conferma strutturale dell&#8217;analita. Questo ulteriore livello di specificit\u00e0 \u00e8 particolarmente prezioso quando si analizzano oligonucleotidi chimicamente modificati o si distinguono metaboliti strettamente correlati che potrebbero non essere differenziati utilizzando solo saggi basati su sonde.   <\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Questa capacit\u00e0 \u00e8 particolarmente preziosa perch\u00e9 gli oligonucleotidi terapeutici subiscono frequentemente degradazione mediata da esonucleasi, producendo metaboliti accorciati come le specie N\u22121 che possono contribuire all&#8217;efficacia o alla sicurezza. LC-MS\/MS \u00e8 anche adatto per oligonucleotidi chimicamente modificati, inclusi oligonucleotidi fosforotioati e molecole coniugate a ligandi, fornendo elevata specificit\u00e0 analitica e affidabilit\u00e0 nell&#8217;identificazione dell&#8217;analita (1\u20134). <\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">I metodi LC-MS\/MS in Kymos supportano l&#8217;analisi di oligonucleotidi terapeutici in plasma e omogenati tissutali. L&#8217;ibridazione con biglie magnetiche sequenza-specifiche consente la purificazione selettiva del campione prima dell&#8217;analisi quantitativa LC-MS\/MS su intervalli di concentrazione tipicamente compresi tra 1 e 1000 ng\/mL. <\/span><\/p>\n<h2><strong>Ibridazione con biglie magnetiche: la chiave per una preparazione selettiva del campione<\/strong><\/h2>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Una preparazione efficiente del campione \u00e8 fondamentale per il successo della bioanalisi LC-MS\/MS. Le matrici biologiche contengono proteine, fosfolipidi e acidi nucleici endogeni che possono interferire con il rilevamento spettrometrico di massa. Per superare queste sfide, Kymos impiega l&#8217;ibridazione con biglie magnetiche sequenza-specifiche prima dell&#8217;analisi LC-MS\/MS (1,2).  <\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Le particelle magnetiche sono funzionalizzate con sonde oligonucleotidiche di cattura complementari alla sequenza terapeutica di interesse. Le sonde di cattura sono immobilizzate sulla superficie delle biglie magnetiche, tipicamente attraverso interazioni biotina-streptavidina, garantendo un legame stabile e altamente selettivo durante tutto il processo di estrazione. Dopo l&#8217;ibridazione, un separatore magnetico isola i complessi biglia-target mentre la restante matrice biologica viene rimossa. Proteine, fosfolipidi e altri componenti endogeni della matrice vengono efficientemente eliminati durante le successive fasi di lavaggio, e un&#8217;eluizione controllata rilascia l&#8217;oligonucleotide purificato per l&#8217;analisi LC-MS\/MS.   <\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Questo flusso di lavoro \u00e8 rapido, altamente selettivo e compatibile con piattaforme automatizzate di gestione dei liquidi, rendendolo adatto per studi ad alta produttivit\u00e0. Rispetto ai metodi di estrazione convenzionali, l&#8217;ibridazione con biglie magnetiche offre diversi vantaggi: <\/span><\/p>\n<ul>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Elevata specificit\u00e0 di sequenza.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Purificazione efficiente da matrici biologiche complesse.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Riduzione degli effetti matrice e della soppressione ionica.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Eccellente riproducibilit\u00e0 e basso trascinamento del campione.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Compatibilit\u00e0 con flussi di lavoro automatizzati ad alta produttivit\u00e0.<\/span><\/li>\n<li><span style=\"font-size: 14pt;\">Discriminazione accurata di metaboliti strettamente correlati, inclusi i prodotti di degradazione N\u22121 (1,2,4).<\/span><\/li>\n<\/ul>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Combinando l&#8217;arricchimento selettivo con il rilevamento LC-MS\/MS altamente specifico, questo flusso di lavoro integrato consente la quantificazione robusta di oligonucleotidi terapeutici in matrici biologiche complesse, supportando studi farmacocinetici, di biodistribuzione e metabolismo.<\/span><\/p>\n<\/div><div class=\"fusion-image-element \" style=\"--awb-caption-title-font-family:var(--h2_typography-font-family);--awb-caption-title-font-weight:var(--h2_typography-font-weight);--awb-caption-title-font-style:var(--h2_typography-font-style);--awb-caption-title-size:var(--h2_typography-font-size);--awb-caption-title-transform:var(--h2_typography-text-transform);--awb-caption-title-line-height:var(--h2_typography-line-height);--awb-caption-title-letter-spacing:var(--h2_typography-letter-spacing);\"><span class=\" fusion-imageframe imageframe-none imageframe-1 hover-type-none\"><img decoding=\"async\" width=\"1536\" height=\"1024\" title=\"LC-MS_MS Bioanalysis Workflow\" src=\"https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow.png\" data-orig-src=\"https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow.png\" alt class=\"lazyload img-responsive wp-image-47616\" srcset=\"data:image\/svg+xml,%3Csvg%20xmlns%3D%27http%3A%2F%2Fwww.w3.org%2F2000%2Fsvg%27%20width%3D%271536%27%20height%3D%271024%27%20viewBox%3D%270%200%201536%201024%27%3E%3Crect%20width%3D%271536%27%20height%3D%271024%27%20fill-opacity%3D%220%22%2F%3E%3C%2Fsvg%3E\" data-srcset=\"https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow-200x133.png 200w, https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow-400x267.png 400w, https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow-600x400.png 600w, https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow-800x533.png 800w, https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow-1200x800.png 1200w, https:\/\/kymos.com\/wp-content\/uploads\/2026\/07\/LC-MS_MS-Bioanalysis-Workflow.png 1536w\" data-sizes=\"auto\" data-orig-sizes=\"(max-width: 850px) 100vw, 1200px\" \/><\/span><\/div><div class=\"fusion-text fusion-text-2\"><p>&nbsp;<\/p>\n<h2><strong>Supportare la prossima generazione di farmaci a base di acidi nucleici<\/strong><\/h2>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">I medicinali a base di acidi nucleici continuano a evolversi e le metodologie bioanalitiche devono anch&#8217;esse progredire per affrontare la loro crescente complessit\u00e0. Piuttosto che sostituire tecniche consolidate come qPCR o ELISA a ibridazione, LC-MS\/MS integra questi approcci fornendo maggiore specificit\u00e0 molecolare e discriminazione dei metaboliti (2\u20134). <\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-size: 14pt;\">Combinando competenze in biologia molecolare con capacit\u00e0 avanzate di spettrometria di massa, Kymos fornisce soluzioni bioanalitiche adattate a ciascuna modalit\u00e0 terapeutica e studio. L&#8217;integrazione di tecniche analitiche complementari consente una caratterizzazione pi\u00f9 completa degli oligonucleotidi terapeutici, supportando studi farmacocinetici, di biodistribuzione e metabolismo fornendo al contempo i dati affidabili necessari per accelerare lo sviluppo della prossima generazione di medicinali a base di acidi nucleici. <\/span><\/p>\n<h3><strong>Riferimenti<\/strong><\/h3>\n<ol>\n<li>Rooney M, Ji QC, Leung K, et al. <em>Hybridization Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry: An Alternative Bioanalytical Method for Antisense Oligonucleotide Quantitation in Plasma and Tissue Samples.<\/em> Analytical Chemistry. 2020;92(15):10239-10247. <\/li>\n<li>Yuan L. <em>Hybridization Liquid Chromatography-Mass Spectrometry for Quantitative Bioanalysis of Oligonucleotides: The Upcoming Paradigm Shift.<\/em> Journal of Chromatography A. 2026;1766:466575.<\/li>\n<li>Yuan L. Bioanalysis of Oligonucleotides. In: Ahuja S, Dong MW, editors.  <em>Specification of Drug Substances and Products: Development and Validation of Analytical Methods.<\/em> Elsevier; 2025. p. 209-243. <\/li>\n<li>Gilar M, Biba M, DeLano M, et al. <em>Bioanalysis of Oligonucleotide by LC-MS: Effects of Ion Pairing Reagents and Recent Advances in Ion-Pairing-Free Analytical Strategies.<\/em> Molecules. 2022;27(23):8875. <\/li>\n<li>European Medicines Agency. <em>Guideline on Bioanalytical Method Validation.<\/em> EMA; 2011.<\/li>\n<li>Resolve Mass Spectrometry. <em>LC-MS Bioanalysis for Oligonucleotides.<\/em> Disponibile su: <a href=\"https:\/\/resolvemass.ca\/lc-ms-bioanalysis-for-oligonucleotides\/\" data-wpel-link=\"external\">https:\/\/resolvemass.ca\/lc-ms-bioanalysis-for-oligonucleotides\/<\/a> (consultato luglio 2026).<\/li>\n<\/ol>\n<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"author":8,"featured_media":47606,"comment_status":"closed","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[253],"tags":[],"class_list":["post-47646","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-bioanalisi"],"acf":[],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v28.1 - 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